Physicist, image analyst and 🔬 studying information flow in networks | Automation and teaching fan #Python #Pi | #bioimage #analyst at @biif_sweden
Stockholm, Sweden
Joined May 2018
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Super Excited to share our integrated Apoptotic Reaction Model! We used #multiplexing to monitor three key nodes in #Apoptosis simultaneously in single cells while extrinsic and intrinsically stimulating them to generate a single dataset. Details in thread!biorxiv.org/content/10.1101/…
Agustin Corbat retweeted
Se viene la tercera edición de nuestro workshop de formación en microscopía de super-resolución. Una vez más con una impresionante lista de expertos invitados. Inscirpción abierta!
@JungmannLab @LabTinnefeld @LabRadenovic janelia.org/lab/lavis-lab
lakadamyali-lab.com/
Organizing meaningful mentorship events for young scientists shouldn't mean starting from scratch. 💡
We published a flexible, open-access guide on Zenodo for hosting interactive, small-cohort student–researcher encounters:
🔗 doi.org/10.5281/zenodo.22710…
2️⃣ Fostering regional collaboration
It also drives regional mobility! By breaking down cultural/language barriers and spotlighting local grants, the format helps students discover and connect directly with regional host labs they might not have otherwise considered.
Intentional mentorship builds stronger, more supportive scientific communities.
Huge thanks to @LatamBioimaging for hosting this event, and to Hernan Grecco & Maria Victoria Repetto for their guidance in designing it! 🙌
#Mentorship #BioimageAnalysis #AcademicMobility
Our **Taller de Fundamentos en Análisis de Bioimágenes (Formación de Formadores)** just ended, and I’m honestly very happy and grateful 💙
Participants made huge progress in fundamentals + reproducible workflows (macros, Git, Pixi).
Proud to teach bioimage analysis in LATAM. Train-the-trainer has exponential impact.
Participants joined from Chile + multiple provinces of Argentina.
Website: acorbat.github.io/2026_TtT_C…
Zenodo: doi.org/10.5281/zenodo.18247…
License: CC-BY 4.0
Very grateful for the international component: @flecumberry joined on-site all week, and Suganya Sivagurunathan + @SchatzCz joined hybrid remote sessions.
Thank you to @infoFundacen, @LatamBioimaging and @GloBIAS_ for all the support!!!
📢 ¡Inscripción abierta! Taller de Fundamentos Análisis de Bioimágenes (Train-the-Trainer) 🔬💻
Para estudiantes, investigadores y personal de centros de servicios que quieran mejorar y enseñar análisis de imágenes.
📅 3-7 de agosto
⏳ Cierre: 16 de julio
👇🧵
3/4 🛠️ ¿Qué cubriremos?
- Fundamentos de procesamiento y validación cuantitativa
- Flujos de trabajo reproducibles (Fiji, Python, Napari)
- Machine Learning y Deep Learning
- Diseño pedagógico de ejercicios y clases de bioimágenes
4/4 📚 El curso incluye una etapa obligatoria de preparación teórica online asincrónica la segunda mitad de julio.
🔗 ¡No te quedes afuera! Toda la información y postulación aquí: forms.gle/Ym27rxzptfaWMsrN7
Agustin Corbat retweeted
Ayer, en el taller “El mundo invisible en tu bolsillo: microscopía con el celular” en el 24.º Foro Internacional de Enseñanza de Ciencias y Tecnologías, en la Feria del Libro de Bs As.
@Fisica_UBA @Exactas_UBA @UBAonline @CONICETDialoga
@ferialibro_ba @LatamBioimaging
¡Ey! 🔬
¿Trabajas con imágenes de difícil análisis? ¿Microscopía?
*Jornada de Análisis de Bioimágenes*
📅 22 de abril
📍 Pabellón 0+Inf, Aula 1306, FCEN-UBA
Charlas, taller hands-on, consultoría con expertos y mucho networking. Gratis.
👉 Anotate acá (o déjanos tu mail):
qrto.org/Cbcb3W
⚠️ La inscripción al taller cierra el miércoles 15 de abril.
¿Preguntas? Contactá a Agustín Corbat: [email protected]
Dejo un link que si funciona:
forms.gle/i35cynNZCJYpe4VV6
Agustin Corbat retweeted
Light-sheet para todos!
@Co_Biologists
@LatamBioimaging
@focalplane_jcs
U. Mayor lideró curso internacional de microscopía Light-sheet diariomayor.cl/ciencia-um/u-…
Agustin Corbat retweeted
Poincare and simbio 1.0.0 have released! We've been working with @GreccoHernan, @maurosilber and @DiNapoli_Tomas
to create poincare, a python library for dynamical systems simualtion, and simbio, which adds bindings for chemical reactions.
¡Qué energía en Quito!🇪🇨 Regreso de KhipuX Quito 2026 inspirado por todo el talento joven en nuestra región. Con el lema "Democratizing AI in Bioimage and Medical Imaging" vi a estudiantes con una determinación admirable por liderar el futuro de la IA.🧵👇
biodecodinglab.github.io/khi…
También dicté el workshop "Introduction to Bioimage Analysis". Cubrimos desde teoría hasta práctica con ejemplos reales. El nivel de los participantes fue increíble; el futuro de la bioimagen está en muy buenas manos. 🔬🤖
¿Te lo perdiste? Todo el material es Open Science y ya está en Zenodo:
📊 Slides: doi.org/10.5281/zenodo.18717…
💻 Material: doi.org/10.5281/zenodo.18772…
¡Gracias @Khipu_AI por la invitación y hacer el evento posible! 🌎✨ #KhipuX #AI #Bioimaging